一、稅捐優惠
（一）園區事業進口自用機器、設備、原料、燃料、物料及半製品免徵進口稅捐、貨物稅及營業稅，且無須辦理免徵、擔保、記帳及押稅手續。
（二）園區事業以產品或勞務外銷者，其營業稅稅率為零。
二、研究發展獎勵辦法
（一）管理局得提供創新技術研究發展獎助金，每個獲得核准之研究發展計畫，最高可獲得獎助金新台幣500萬元，但以不超過該計畫所需資金之50％為限；另申請者應完成公司登記入區營運且提具公司未來5年之研究發展整體計畫。
（二）研究發展費用在一定額度內可扣抵所得稅。
（三）使用於研究與發展之機器設備可免進口稅捐。
（四）捐贈研發設備可作費用列支。